Thuế GTGT phát sinh trước ngày 1/7/2025 có được áp dụng chính sách hoàn thuế mới

Việc chuyển đổi chính sách thuế giữa các thời điểm giao thoa thường gây ra nhiều lúng túng cho doanh nghiệp trong quá trình thực hiện thủ tục hoàn thuế. Đặc biệt, với sự ra đời của Nghị định số 181/2025/NĐ-CP có hiệu lực từ ngày 1/7/2025, câu hỏi đặt ra là các khoản thuế GTGT đầu vào phát sinh từ hoạt động xuất khẩu trước thời điểm này sẽ được xử lý theo quy định cũ hay mới. Cục Thuế đã có hướng dẫn chi tiết tại Công văn số 6068/CT-CS ngày 17/12/2025 để làm rõ vấn đề này.

Tải ngay tài liệu tóm tắt

Hiệu lực thi hành của Nghị định 181/2025/NĐ-CP về hoàn thuế GTGT

Theo lưu ý của Cục Thuế, Nghị định số 181/2025/NĐ-CP bắt đầu có hiệu lực thi hành kể từ ngày 1/7/2025. Văn bản này bao gồm các quy định cập nhật về đối tượng và điều kiện được hoàn thuế GTGT. Việc xác định đúng thời điểm có hiệu lực là cơ sở pháp lý quan trọng nhất để doanh nghiệp đối chiếu các hành vi và sự kiện kinh tế phát sinh trong kỳ.

Nguyên tắc áp dụng pháp luật đối với các sự kiện thuế

Căn cứ vào nguyên tắc áp dụng pháp luật được quy định tại Điều 58 Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật, một văn bản pháp luật sẽ được áp dụng từ thời điểm bắt đầu có hiệu lực đối với các hành vi và sự kiện xảy ra tại thời điểm mà văn bản đó đang có hiệu lực.

Điều này đồng nghĩa với việc chính sách thuế không có tính chất hồi tố đối với các sự kiện đã kết thúc trước khi văn bản mới có hiệu lực, trừ khi có quy định chuyển tiếp đặc biệt. Trong lĩnh vực thuế GTGT, việc hoàn thuế gắn liền với từng kỳ tính thuế cụ thể (tháng hoặc quý), do đó nguyên tắc này được áp dụng triệt để theo từng mốc thời gian phát sinh nghĩa vụ hoặc quyền lợi thuế.

Quy định về việc áp dụng chính sách hoàn thuế theo tháng và quý

Theo hướng dẫn tại Công văn số 6068/CT-CS, việc hoàn thuế GTGT được thực hiện dựa trên nguyên tắc: Hoàn thuế theo tháng hoặc quý nào thì áp dụng chính sách thuế GTGT về hoàn thuế có hiệu lực đối với tháng hoặc quý đó.

Cụ thể đối với trường hợp cơ sở kinh doanh có hàng hóa và dịch vụ xuất khẩu:

Đối với kỳ tính thuế trước ngày 1/7/2025: Nếu doanh nghiệp có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên và đáp ứng đầy đủ các điều kiện hoàn thuế theo quy định pháp luật tại thời điểm đó, thì việc xét duyệt hoàn thuế sẽ tuân theo chính sách cũ.
Đối với kỳ tính thuế từ ngày 1/7/2025 trở đi: Mọi đối tượng, điều kiện và hồ sơ hoàn thuế sẽ phải tuân thủ nghiêm ngặt các quy định mới tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP.

Doanh nghiệp cần lưu ý rằng, dù chính sách về điều kiện hoàn thuế có thể thay đổi giữa hai giai đoạn, nhưng thủ tục hành chính về quản lý thuế vẫn phải thực hiện theo đúng quy định hiện hành của pháp luật về quản lý thuế tại thời điểm nộp hồ sơ.

Lưu ý cho doanh nghiệp khi lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế GTGT

Để đảm bảo quyền lợi và tránh các sai sót dẫn đến việc bị từ chối hồ sơ hoàn thuế, doanh nghiệp cần chú trọng các điểm sau:

Phân loại chính xác số thuế GTGT đầu vào tương ứng với từng kỳ tính thuế. Không gộp chung các khoản thuế phát sinh từ hai thời kỳ chính sách khác nhau vào một hồ sơ nếu không có hướng dẫn tách biệt rõ ràng.
Rà soát điều kiện hoàn thuế của kỳ tính thuế trước ngày 1/7/2025 để đảm bảo số thuế chưa khấu trừ hết đạt ngưỡng 300 triệu đồng theo quy định cũ (theo Công văn số 6068/CT-CS ngày 17/12/2025 của Cục Thuế).
Cập nhật các mẫu biểu và quy định mới về đối tượng hoàn thuế tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP cho các tờ khai từ tháng 7 năm 2025 hoặc quý 3 năm 2025 trở đi.
Đảm bảo tính hợp pháp, hợp lệ của chứng từ thanh toán qua ngân hàng đối với hàng hóa xuất khẩu, đây luôn là điều kiện tiên quyết trong mọi thời kỳ chính sách.

Việc nắm vững mốc thời gian 1/7/2025 sẽ giúp doanh nghiệp chủ động trong kế hoạch tài chính và tối ưu hóa dòng tiền thông qua công tác hoàn thuế đúng quy định pháp luật.

Thông tin liên hệ MAN – Master Accountant Network

Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
Email: man@man.net.vn

Các dịch vụ khác

Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.