Thuế GTGT 2025 và những thay đổi tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP

Thuế GTGT 2025 là chủ đề được cộng đồng doanh nghiệp đặc biệt quan tâm khi Chính phủ ban hành Nghị định 181/2025/NĐ-CP và Nghị định 359/2025/NĐ-CP nhằm cải cách mạnh mẽ chính sách thuế. Những quy định mới này không chỉ tác động đến việc kê khai hàng nông sản mà còn triệt tiêu các nút thắt trong thủ tục hoàn thuế, vốn là rào cản lớn bấy lâu nay. Việc nắm bắt kịp thời các thay đổi về thuế GTGT 2025 áp dụng từ ngày 1/7/2025 sẽ giúp doanh nghiệp chủ động trong kế hoạch tài chính và tận dụng tối đa các ưu đãi từ Chính phủ.

Lộ trình áp dụng thuế GTGT 2025 theo các nghị định mới

Sự thay đổi về khung pháp lý thuế giá trị gia tăng trong giai đoạn này được thực hiện theo lộ trình phân tầng nhằm đảm bảo doanh nghiệp có đủ thời gian thích nghi. Cụ thể về lộ trình thực thi:

Nghị định 181/2025/NĐ-CP chính thức có hiệu lực từ ngày 1/7/2025, thay thế hoàn toàn cho Nghị định 209/2013/NĐ-CP và các văn bản sửa đổi liên quan như Nghị định 49/2022/NĐ-CP.
Nghị định 359/2025/NĐ-CP đóng vai trò là văn bản sửa đổi, bổ sung trực tiếp vào Nghị định 181, tập trung vào các nhóm ngành đặc thù và có hiệu lực từ ngày 1/1/2026.

Việc ban hành song hành hai văn bản này cho thấy quyết tâm của cơ quan quản lý trong việc cầu thị, lắng nghe khó khăn của doanh nghiệp để điều chỉnh chính sách thuế GTGT 2025 theo hướng minh bạch và công bằng hơn.

Quy định mới về kê khai sản phẩm nông nghiệp

Chính sách thuế đối với mặt hàng nông sản tại khâu kinh doanh thương mại luôn là vấn đề phức tạp. Với những cập nhật mới, các quy tắc đã được hệ thống hóa lại để tránh việc hiểu sai hoặc áp dụng không thống nhất.

Đối tượng không phải kê khai tính nộp thuế

Theo bổ sung tại Khoản 1b Điều 4 Nghị định 181 (thông qua Nghị định 359), một cơ chế ưu đãi quan trọng đã được thiết lập cho các chuỗi cung ứng nông sản. Cụ thể, các đơn vị cần lưu ý về chính sách thuế GTGT 2025:

Doanh nghiệp, hợp tác xã mua sản phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản chưa chế biến hoặc sơ chế thông thường để bán cho doanh nghiệp, hợp tác xã khác thì không phải kê khai, tính nộp thuế giá trị gia tăng.
Dù không phải nộp thuế đầu ra, các đơn vị này vẫn được thực hiện khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào theo quy định.

Thuế suất áp dụng cho các nhóm đối tượng kinh doanh khác

Trong trường hợp không thuộc diện miễn kê khai nêu trên, mức thuế suất sẽ được phân định rõ ràng dựa trên phương pháp tính thuế của người bán và tính chất của người mua:

Khi bán cho hộ, cá nhân kinh doanh hoặc các tổ chức không phải doanh nghiệp: Phải tính thuế giá trị gia tăng theo mức 5%.
Đối với người bán nộp thuế theo phương pháp trực tiếp trên doanh thu: Mức thuế phải nộp được xác định bằng tỷ lệ 1% nhân với doanh thu thực tế.

Tháo gỡ nút thắt về điều kiện hoàn thuế cho doanh nghiệp

Điểm sáng nhất trong các thay đổi áp dụng từ giai đoạn thuế GTGT 2025 chính là việc bãi bỏ những điều kiện gây khó cho doanh nghiệp trong quá trình xin hoàn thuế. Đây được coi là bước đi mang tính “cởi trói” cho dòng tiền của các đơn vị xuất khẩu và đầu tư.

Quy định mới về kê khai sản phẩm nông nghiệp

Bãi bỏ trách nhiệm liên đới về nghĩa vụ nộp thuế của người bán

Trước đây, doanh nghiệp thường gặp khó khăn khi hồ sơ hoàn thuế bị treo do cơ quan thuế xác định “người bán chưa nộp đủ thuế”. Tại Nghị định 359/2025/NĐ-CP, Chính phủ đã chính thức bãi bỏ Khoản 3 Điều 37 của Nghị định 181. Điều này đồng nghĩa với việc:

Doanh nghiệp đề nghị hoàn thuế không còn phải chịu trách nhiệm cho việc tuân thủ pháp luật thuế của nhà cung cấp.
Miễn là hóa đơn đầu vào hợp lệ và có chứng từ thanh toán đúng quy định, quyền lợi hoàn thuế của doanh nghiệp sẽ được bảo vệ tối đa theo khung pháp lý thuế GTGT 2025.

Quy định chuyển tiếp giúp đẩy nhanh tiến độ hoàn thuế

Để đảm bảo tính liên tục và không gây thiệt hại cho các đơn vị đang trong quá trình thực hiện thủ tục, Nghị định cũng đưa ra hướng dẫn cụ thể:

Các hồ sơ đề nghị hoàn thuế đã gửi trước ngày 1/1/2026 nhưng chưa có quyết định cuối cùng sẽ được áp dụng ngay quy định mới (không phải đáp ứng điều kiện về việc người bán đã nộp thuế).
Sự thay đổi này giúp đẩy nhanh tiến độ xử lý hồ sơ, giảm bớt sự chậm trễ gây ảnh hưởng đến năng lực tài chính của doanh nghiệp trong kỳ thuế GTGT 2025.

So sánh điều kiện khấu trừ thuế giữa quy định cũ và mới

Điều kiện để được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào là nghiệp vụ cốt yếu của kế toán. Dưới đây là bảng so sánh các điểm thay đổi quan trọng để doanh nghiệp dễ dàng đối chiếu:

Trước khi áp dụng quy định mới, việc kiểm soát chứng từ thanh toán thường khá cứng nhắc. Bảng dưới đây tóm tắt sự khác biệt:

Bảng so sánh điều kiện khấu trừ thuế giữa quy định cũ và mới
Tiêu chí	Quy định cũ (NĐ 209, NĐ 49)	Quy định mới thuế GTGT 2025
Hóa đơn trên 20 triệu	Phải có chứng từ không dùng tiền mặt, nếu chưa có tại thời điểm quyết toán phải điều chỉnh giảm.	Vẫn được khấu trừ khi chưa đến hạn thanh toán. Chỉ điều chỉnh giảm khi đến hạn mà không có chứng từ.
Chứng từ thay thế	Chưa quy định cụ thể các trường hợp đặc biệt.	Chấp nhận giấy tờ thay thế nếu hàng hóa bị tổn thất, tiêu hủy hoặc bên mua mất khả năng thanh toán.
Thời điểm điều chỉnh	Thường yêu cầu điều chỉnh ngay trong kỳ phát sinh nếu không có chứng từ.	Cho phép theo dõi đến thời điểm thanh toán thực tế theo hợp đồng.

Lưu ý rằng theo kinh nghiệm từ đội ngũ chuyên gia tại MAN – Master Accountant Network, doanh nghiệp cần lưu trữ đầy đủ các hồ sơ minh chứng đối với các trường hợp sử dụng giấy tờ thay thế chứng từ thanh toán để giải trình khi thanh tra, kiểm tra thuế GTGT 2025.

Quản lý thuế đối với hoạt động kinh doanh trên sàn thương mại điện tử

Trong bối cảnh kinh tế số phát triển mạnh mẽ, Nghị định 181/2025/NĐ-CP đã bổ sung các quy định chi tiết nhằm quản lý thuế hiệu quả hơn đối với các giao dịch xuyên biên giới.

Các sàn giao dịch và nền tảng số có chức năng thanh toán phải chịu trách nhiệm kê khai, nộp thuế thay cho hộ, cá nhân kinh doanh theo hướng dẫn tại Nghị định 117/2025/NĐ-CP.
Đối với hàng hóa dịch vụ xuất khẩu qua sàn, doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ hồ sơ chứng minh việc tiêu dùng ngoài lãnh thổ Việt Nam để được hưởng thuế suất 0% theo đúng quy định thuế GTGT 2025.

Những sửa đổi quan trọng về giá tính thuế và thời điểm xác định thuế

Ngoài các thay đổi về khấu trừ, chính sách mới còn chi tiết hóa các quy tắc định giá và thời điểm phát sinh nghĩa vụ thuế để giảm thiểu tranh chấp giữa người nộp thuế và cơ quan quản lý.

Đối với ngành viễn thông và điện, nước: Thời điểm xác định thuế là ngày chốt chỉ số số lượng hàng hóa dịch vụ hoặc ngày lập hóa đơn.
Đối với bất động sản: Giá tính thuế là giá chuyển nhượng trừ đi giá đất được trừ theo quy định cụ thể của pháp luật đất đai hiện hành.
Ngưỡng hoàn thuế cho dự án đầu tư vẫn giữ mức 300 triệu đồng, tuy nhiên quy định rõ số thuế được hoàn không vượt quá 10% doanh thu của dự án trong kỳ thuế GTGT 2025.

Danh mục các quy định bị bãi bỏ từ ngày 1/7/2025

Việc loại bỏ các quy định lỗi thời giúp hệ thống pháp luật trở nên tinh gọn và tập trung hơn. Dưới đây là các điểm chính bị gỡ bỏ:

Gỡ bỏ quy định về ngưỡng doanh thu 100 triệu đồng của hộ kinh doanh tại Nghị định 209 (nội dung này hiện được quản lý theo Luật Thuế thu nhập cá nhân).
Loại bỏ việc khấu trừ thuế đầu vào đối với tài sản cố định chuyên dùng sản xuất sản phẩm quốc phòng, an ninh và máy bay, du thuyền không kinh doanh vận tải.
Bãi bỏ quy định hạch toán thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ vào chi phí tính thuế TNDN đối với các trường hợp thiếu chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt trong năm thuế GTGT 2025.

Tác động tổng thể của chính sách đến cộng đồng doanh nghiệp

Nhìn một cách tổng thể, lộ trình thay đổi chính sách thuế GTGT 2025 thể hiện tinh thần đồng hành cùng doanh nghiệp của Chính phủ. Việc đơn giản hóa các điều kiện hoàn thuế và làm rõ cách tính thuế cho hàng nông sản sẽ tạo ra môi trường kinh doanh minh bạch, giảm thiểu rủi ro pháp lý cho kế toán. Các chuyên gia tại MAN – Master Accountant Network khuyến nghị doanh nghiệp nên chủ động rà soát hệ thống quản trị để đảm bảo sự tương thích với các quy định mới này thông qua việc sử dụng các dịch vụ quyết toán thuế chuyên nghiệp.

Kết luận về sự thay đổi chính sách thuế GTGT 2025

Để thích ứng tốt nhất với thuế GTGT 2025, các doanh nghiệp cần thực hiện rà soát lại toàn bộ hệ thống hóa đơn, chứng từ và cập nhật các quy trình kê khai theo mẫu biểu mới trước thời điểm tháng 7 năm 2025. Sự chuẩn bị kỹ lưỡng không chỉ giúp doanh nghiệp tuân thủ đúng pháp luật mà còn tối ưu hóa được dòng tiền thông qua việc hoàn thuế và khấu trừ chính xác. Đây là thời điểm vàng để doanh nghiệp chuẩn hóa lại quy trình tài chính dưới sự hỗ trợ của các mạng lưới chuyên gia chuyên nghiệp.

Thông tin liên hệ MAN – Master Accountant Network

Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
Email: man@man.net.vn

Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.