Hàng xuất khẩu bị trả lại: Doanh nghiệp Vẫn Phải nộp thuế GTGT khâu nhập khẩu

Cục Hải quan vừa có hướng dẫn quan trọng tại Công văn 33668/CHQ-NVTHQ về thuế GTGT đối với hàng hóa xuất khẩu sau đó phải tái nhập về Việt Nam. Theo đó, các lô hàng tái nhập vẫn thuộc đối tượng chịu thuế GTGT ở khâu nhập khẩu, nhưng doanh nghiệp có thể thực hiện khấu trừ hoặc hoàn thuế khi bán ra.

Cục Hải quan vừa ban hành Công văn số 33668/ CHQ-NVTHQ nngày 05/11/2025, trả lời vướng mắc của một số đơn vị hải quan về việc áp dụng thuế giá trị gia tăng (GTGT) đối với hàng hóa xuất khẩu nhưng sau đó nhập khẩu trở lại (tái nhập).

Đây là quy định mà các doanh nghiệp thường xuyên có hoạt động xuất nhập khẩu, đặc biệt là các doanh nghiệp xuất khẩu bị đối tác nước ngoài trả lại hàng do lỗi chất lượng, cần đặc biệt lưu ý.

Hàng tái nhập vẫn thuộc đối tượng chịu thuế GTGT

Theo hướng dẫn của Cục Hải quan, trường hợp hàng hóa đã xuất khẩu nhưng sau đó nhập khẩu trở lại Việt Nam vẫn thuộc đối tượng chịu thuế GTGT ở khâu nhập khẩu.

Cơ sở pháp lý cho quy định này là căn cứ vào Điều 3 Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15 (có hiệu lực từ ngày 01/7/2025). Điều luật này quy định rõ:

Hàng hóa, dịch vụ sử dụng cho sản xuất, kinh doanh và tiêu dùng ở Việt Nam là đối tượng chịu thuế giá trị gia tăng, trừ các đối tượng quy định tại Điều 5 của Luật này.

Khi hàng hóa được tái nhập khẩu và quay trở lại lãnh thổ Việt Nam để sử dụng, lưu thông hoặc tiêu thụ, về bản chất nó đã trở thành hàng hóa sử dụng trong nước và do đó thuộc diện chịu thuế GTGT như hàng nhập khẩu thông thường, trừ các đối tượng được quy định không chịu thuế tại Điều 5 của Luật.

Số thuế GTGT đã nộp được khấu trừ, hoàn thuế

Mặc dù doanh nghiệp phải nộp thuế GTGT khi tái nhập hàng, Cục Hải quan cũng lưu ý về quyền lợi của doanh nghiệp liên quan đến số thuế đã nộp này.

Công văn số 33668/CHQ-NVTHQ khẳng định: Số thuế GTGT đã nộp ở khâu nhập khẩu của hàng hóa tái nhập được khấu trừ, hoàn thuế khi doanh nghiệp thực hiện bán ra (tiêu thụ) lô hàng này.

Tuy nhiên, việc khấu trừ hoặc hoàn thuế phải đảm bảo đáp ứng các điều kiện theo quy định tại Điều 14 (Khấu trừ thuế GTGT đầu vào) và Điều 15 (Hoàn thuế GTGT) của Luật Thuế GTGT số 48/2024/QH15.

Lưu ý quan trọng cho Doanh nghiệp:

Do quy trình khấu trừ và hoàn thuế GTGT đầu vào thuộc thẩm quyền của cơ quan Thuế nội địa (nơi doanh nghiệp đăng ký kê khai, nộp thuế), Cục Hải quan đề nghị các đơn vị hướng dẫn công ty liên hệ trực tiếp với cơ quan Thuế để được hướng dẫn cụ thể về hồ sơ, thủ tục khấu trừ hoặc hoàn thuế theo đúng quy định.

Kết luận

Quy định tại Công văn 33668/CHQ-NVTHQ là cơ sở pháp lý quan trọng để doanh nghiệp thực hiện nghĩa vụ và quyền lợi thuế GTGT đối với hàng hóa tái nhập sau xuất khẩu. Doanh nghiệp cần chủ động nắm rõ: