Thanh toán trễ hạn có được khấu trừ bổ sung thuế đầu vào?

Ngày 21/8/2025, Cục Thuế tỉnh Vĩnh Long đã ban hành Công văn số 434/VLO-QLDN2 về việc xử lý trường hợp chậm thanh toán theo hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng khi xác định quyền khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT) đầu vào. Nội dung văn bản nhận được nhiều sự quan tâm của doanh nghiệp bởi liên quan trực tiếp đến điều kiện khấu trừ thuế trong hoạt động sản xuất, kinh doanh.

Quy định mới về điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào

Từ ngày 1/7/2025, điều kiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào được áp dụng theo điểm g khoản 2 Điều 26 Nghị định 181/2025/NĐ-CP. Trong đó, đáng chú ý là trường hợp mua hàng hóa, dịch vụ trả chậm hoặc trả góp có giá trị từ 5 triệu đồng trở lên.

Theo quy định, nếu đến thời điểm thanh toán theo hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng mà doanh nghiệp chưa có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, thì bắt buộc phải kê khai, điều chỉnh giảm số thuế GTGT đầu vào được khấu trừ tương ứng với phần giá trị chưa có chứng từ thanh toán.

Việc điều chỉnh giảm được thực hiện ngay trong kỳ tính thuế phát sinh nghĩa vụ thanh toán theo hợp đồng đã ký.

Vấn đề đặt ra: Có được khấu trừ bổ sung sau khi thanh toán trễ hạn?

Một trong những thắc mắc lớn của doanh nghiệp là: sau khi đã kê khai giảm thuế GTGT đầu vào vì chậm thanh toán, nếu sau đó doanh nghiệp thực hiện thanh toán bằng hình thức không dùng tiền mặt (dù trễ so với hợp đồng), thì có được khấu trừ bổ sung phần thuế đã giảm hay không?

Theo Công văn số 434/VLO-QLDN2, căn cứ Nghị định 181/2025/NĐ-CP, hiện chưa có quy định cho phép khấu trừ bổ sung đối với số thuế GTGT đầu vào đã kê khai giảm. Điều này đồng nghĩa, doanh nghiệp thanh toán sau thời hạn thỏa thuận trong hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng sẽ không được phục hồi lại quyền khấu trừ thuế cho khoản chi phí đó, kể cả khi có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt.

Ý nghĩa đối với doanh nghiệp

Quy định mới có tác động trực tiếp đến quản trị tài chính, kế toán của doanh nghiệp. Một số điểm cần lưu ý:

Doanh nghiệp phải chủ động bố trí dòng tiền để thanh toán đúng hạn nhằm bảo toàn quyền khấu trừ thuế GTGT đầu vào.
Việc thanh toán chậm sẽ không chỉ ảnh hưởng đến quan hệ với đối tác, mà còn làm tăng chi phí thuế vì không được khấu trừ lại sau này.
Cơ quan thuế có thể xem đây là biện pháp siết chặt việc sử dụng chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, góp phần minh bạch hóa dòng tiền và hạn chế rủi ro gian lận thuế.

Nhận định

Với việc Nghị định 181/2025/NĐ-CP không có cơ chế khấu trừ bổ sung, doanh nghiệp cần đặc biệt cẩn trọng khi ký kết hợp đồng trả chậm, trả góp. Trong trường hợp khó khăn về dòng tiền, nên thương lượng lại điều khoản thanh toán với đối tác để tránh rơi vào tình trạng mất quyền khấu trừ thuế đầu vào.

Công văn số 434/VLO-QLDN2 của Cục Thuế Vĩnh Long đã làm rõ điểm quan trọng: thanh toán trễ hạn không giúp doanh nghiệp phục hồi quyền khấu trừ thuế GTGT đầu vào đã bị điều chỉnh giảm. Đây là cơ sở pháp lý để các doanh nghiệp rà soát lại quy trình thanh toán và tuân thủ quy định mới từ 1/7/2025.

Nếu doanh nghiệp cần tư vấn chi tiết về chính sách thuế và các vấn đề kế toán liên quan, hãy liên hệ MAN – Master Accountant Network để được hỗ trợ kịp thời.

Thông tin liên hệ MAN