Công văn 5746/CT-CS giới thiệu điểm mới Thông tư 89/2026/TT-BTC

Ngày 10/8/2026, Cục Thuế đã ban hành Công văn 5746/CT-CS giới thiệu một số nội dung mới tại Thông tư 89/2026/TT-BTC do Bộ Tài chính ban hành ngày 30/6/2026 (có hiệu lực từ ngày 01/7/2026). Văn bản làm rõ quy định về phân nhóm người nộp thuế trong quản lý thuế dựa trên mức độ tuân thủ và rủi ro, đồng thời hướng dẫn các điều chỉnh trong quy trình đăng ký, bổ sung thông tin và ngừng giao dịch thuế điện tử đối với doanh nghiệp và cá nhân.

Bối cảnh ban hành Công văn 5746/CT-CS

Nhằm giúp người nộp thuế và cơ quan thuế các cấp nắm bắt kịp thời các quy định mới trong quản lý thuế, ngày 10/8/2026, Cục Thuế ban hành Công văn 5746/CT-CS giới thiệu một số nội dung mới tại Thông tư 89/2026/TT-BTC.

Thông tư 89/2026/TT-BTC hướng dẫn thi hành Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15 và Nghị định 252/2026/NĐ-CP. Việc ban hành Công văn 5746/CT-CS tập trung làm rõ hai nhóm nội dung then chốt gồm phân nhóm người nộp thuế trong quản lý thuế và các điều chỉnh quan trọng đối với thủ tục giao dịch thuế điện tử.

Quy định mới về phân nhóm người nộp thuế trong quản lý thuế

Tại Điều 4 Thông tư 89/2026/TT-BTC, Bộ Tài chính bổ sung quy định về phân nhóm người nộp thuế trong quản lý thuế.

Chi tiết 03 khoản quy định tại Điều 4:

• Khoản 1 – Mục đích phân nhóm: Phục vụ công tác quản lý thuế, bao gồm việc xác định chế độ ưu tiên theo quy định tại Điều 48 Nghị định 252/2026/NĐ-CP; phân bổ nguồn lực và áp dụng biện pháp quản lý phù hợp; thực hiện phân tích, đánh giá mức độ rủi ro về thuế, mức độ tuân thủ pháp luật về thuế và thực hiện thanh tra, kiểm tra theo mức độ rủi ro.
• Khoản 2 – Hệ thống tiêu chí phân nhóm: Xác định dựa trên cơ sở địa bàn hoạt động, loại người nộp thuế, quy mô, ngành nghề, lĩnh vực hoạt động, loại hình pháp lý, cơ cấu sở hữu, mức độ tuân thủ, lịch sử tuân thủ và mức độ rủi ro về thuế.
• Khoản 3 – Biện pháp quản lý tương ứng: Quy định các biện pháp thích đáng theo phân nhóm người nộp thuế dựa trên mức độ tuân thủ và mức độ rủi ro, bảo đảm phù hợp và thống nhất với Thông tư 94/2026/TT-BTC ngày 01/7/2026 của Bộ Tài chính về quản lý rủi ro, quản lý tuân thủ trong quản lý thuế.

Cơ quan thuế thực hiện phân nhóm người nộp thuế theo Điều 4 Thông tư 89/2026/TT-BTC nhằm áp dụng quy trình, biện pháp quản lý phù hợp, phân bổ nguồn lực và xác định chế độ ưu tiên trong quản lý thuế đối với từng nhóm đối tượng.

Thay đổi về đăng ký, bổ sung thông tin và ngừng giao dịch thuế điện tử

Tại Điều 13 Thông tư 89/2026/TT-BTC, các quy định về đăng ký, thay đổi, bổ sung thông tin và ngừng giao dịch thuế điện tử được điều chỉnh cập nhật nhằm phù hợp với hệ thống định danh điện tử và thực tiễn quản lý.

Sử dụng tài khoản định danh điện tử

Theo khoản 1 Điều 13 Thông tư 89/2026/TT-BTC, người nộp thuế thuộc đối tượng được định danh điện tử sử dụng tài khoản định danh điện tử mức độ 02 (đối với công dân Việt Nam) hoặc tài khoản định danh điện tử (đối với người nước ngoài) để giao dịch với cơ quan thuế. Việc cập nhật, thay đổi thông tin thực hiện trên Cổng Dịch vụ công quốc gia theo hướng dẫn của chủ quản hệ thống thông tin. Các nghiệp vụ đăng ký và kê khai cá nhân có thể tham khảo qua dịch vụ tư vấn thuế thu nhập cá nhân.

Ấn định thời hạn cập nhật thông tin thay đổi là 03 ngày làm việc

Điểm b khoản 3 Điều 13 Thông tư 89/2026/TT-BTC sửa đổi thời hạn người nộp thuế cập nhật thay đổi, bổ sung thông tin đăng ký giao dịch điện tử với cơ quan thuế qua Hệ thống Thuế điện tử. Quy định mới ấn định rõ ràng thời hạn cập nhật là trong thời hạn 03 ngày làm việc kể từ ngày phát sinh thay đổi. Doanh nghiệp sử dụng dịch vụ kế toán báo cáo thuế cần lưu ý mốc thời gian này để chuẩn hóa hồ sơ kê khai.

Quy định về ngừng giao dịch và giao dịch qua cổng thông tin thủ tục hành chính

Thông tư 89/2026/TT-BTC bổ sung và làm rõ trường hợp ngừng thực hiện giao dịch thuế điện tử đối với người nộp thuế đã bị cơ quan thuế thông báo không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký, sau đó nộp hồ sơ thực hiện thủ tục chấm dứt hiệu lực mã số thuế hoặc khôi phục mã số thuế. Đồng thời, văn bản bổ sung quy định đối với người nộp thuế đã đăng ký giao dịch điện tử qua Cổng Hệ thống thông tin giải quyết thủ tục hành chính của cơ quan nhà nước có thẩm quyền.

Đơn giản hóa các thủ tục hành chính thuế

Bên cạnh các nội dung chính về phân nhóm và giao dịch điện tử, một số thủ tục hành chính tại Thông tư 89/2026/TT-BTC đã được rà soát và đơn giản hóa nhằm bảo đảm tính thống nhất với Luật Quản lý thuế và pháp luật về giao dịch điện tử:

• Quy định bãi bỏ đăng ký nộp thuế điện tử: Bỏ quy định về đăng ký nộp thuế điện tử cho người nộp thuế.
• Quy định bãi bỏ thông báo thời hạn phản hồi: Bỏ quy định về thời hạn thông báo về việc chấp nhận hay không chấp nhận thông tin thay đổi, bổ sung cho người nộp thuế.

Lưu ý chuyên môn từ MAN – Master Accountant Network

Đội ngũ chuyên gia từ giải pháp dịch vụ tư vấn kế toán thuế tại MAN – Master Accountant Network tổng hợp các lưu ý thực tiễn dành cho các chủ doanh nghiệp, Giám đốc tài chính (CFO) và bộ phận kế toán:

• Khuyến nghị 1 – Tuân thủ nghiêm ngặt thời hạn 03 ngày làm việc: Khi có bất kỳ thay đổi, bổ sung thông tin đăng ký giao dịch điện tử, kế toán cần thực hiện cập nhật trong vòng 03 ngày làm việc kể từ ngày phát sinh thay đổi.
• Khuyến nghị 2 – Chuẩn hóa tài khoản định danh điện tử: Người nộp thuế thuộc đối tượng được định danh điện tử cần đảm bảo tài khoản định danh điện tử mức độ 02 (đối với công dân Việt Nam) đã được kích hoạt để sẵn sàng thực hiện các giao dịch trực tuyến.
• Khuyến nghị 3 – Nâng cao mức độ tuân thủ pháp luật thuế: Theo Điều 4 Thông tư 89/2026/TT-BTC, người nộp thuế tuân thủ tốt pháp luật thuế và có mức độ rủi ro thấp sẽ được áp dụng chế độ ưu tiên trong quản lý thuế.

Kết luận

Công văn 5746/CT-CS của Cục Thuế đã hệ thống hóa các điểm mới quan trọng tại Thông tư 89/2026/TT-BTC, tập trung vào phân nhóm quản lý thuế và điều chỉnh các quy trình giao dịch thuế điện tử. Doanh nghiệp có thể tham khảo bảng giá dịch vụ tư vấn thuế để lựa chọn phương án hỗ trợ rà soát thông tin đăng ký và quy trình kê khai điện tử nhằm bảo đảm tuân thủ đầy đủ các quy định pháp lý hiện hành.

Câu hỏi thường gặp

Thời hạn cập nhật thay đổi thông tin đăng ký giao dịch thuế điện tử là bao lâu?

Theo điểm b khoản 3 Điều 13 Thông tư 89/2026/TT-BTC, người nộp thuế phải cập nhật thay đổi, bổ sung thông tin đăng ký giao dịch điện tử với cơ quan thuế trong thời hạn 03 ngày làm việc kể từ ngày phát sinh thay đổi.

Phân nhóm người nộp thuế tại Điều 4 Thông tư 89/2026/TT-BTC gồm các tiêu chí nào?

Khoản 2 Điều 4 Thông tư 89/2026/TT-BTC quy định tiêu chí phân nhóm người nộp thuế dựa trên địa bàn hoạt động, loại người nộp thuế, quy mô, ngành nghề, lĩnh vực hoạt động, loại hình pháp lý, cơ cấu sở hữu, mức độ tuân thủ, lịch sử tuân thủ và mức độ rủi ro về thuế.