Kê khai hóa đơn GTGT đầu vào theo Công văn số 2703/VLO-QLDN3

Ngày 12/8/2026, Thuế tỉnh Vĩnh Long đã ban hành Công văn số 2703/VLO-QLDN3 hướng dẫn về việc kê khai, khấu trừ hóa đơn giá trị gia tăng (GTGT) đầu vào cho doanh nghiệp. Văn bản giải đáp vướng mắc cụ thể về phương pháp điều chỉnh chỉ tiêu [37] và [38] khi phát hiện sai sót hóa đơn GTGT, cũng như quy định khấu trừ thuế đối với hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp từ 05 triệu đồng trở lên. Đây là tài liệu tham khảo hữu ích giúp chủ doanh nghiệp và bộ phận kế toán nắm bắt hướng xử lý của cơ quan thuế để thực hiện kê khai thuế theo đúng quy định hiện hành.

Quy định điều chỉnh hóa đơn GTGT đầu vào sai sót

Theo Công văn số 2703/VLO-QLDN3 của Thuế tỉnh Vĩnh Long, trường hợp doanh nghiệp phát hiện hóa đơn điện tử có số thuế GTGT đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai, sót thì thực hiện kê khai vào chỉ tiêu [37] hoặc [38] của tháng, quý phát hiện sai, sót. Quy định này áp dụng khi việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh thuế GTGT đầu vào bị sai, sót làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau (không phải khai bổ sung hồ sơ khai thuế) theo quy định tại Điều 12 Nghị định số 252/2026/NĐ-CP và Thông tư số 89/2026/TT-BTC.

Trường hợp phát hiện sai sót hóa đơn GTGT đầu vào nhưng việc kê khai vào kỳ phát sinh làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế đã được hoàn, người nộp thuế bắt buộc phải lập hồ sơ khai bổ sung cho kỳ tính thuế phát sinh sai sót đó. Khi đó, doanh nghiệp phải nộp đủ số tiền thuế tăng thêm hoặc bị thu hồi tiền thuế đã hoàn tương ứng và nộp tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước (nếu có) theo quy định tại điểm đ khoản 1 Điều 14 Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH15 và khoản 6 Điều 12 Nghị định số 252/2026/NĐ-CP.

Kê khai thuế GTGT với hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp

Công văn số 2703/VLO-QLDN3 xác định đối với hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp có giá trị mua từ 05 triệu đồng trở lên, doanh nghiệp chưa có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt do chưa đến thời điểm thanh toán theo hợp đồng, phụ lục hợp đồng thì vẫn được kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào. Khi đến thời điểm thanh toán theo hợp đồng, phụ lục hợp đồng mà không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, doanh nghiệp phải kê khai điều chỉnh giảm số thuế GTGT đầu vào đối với phần giá trị không có chứng từ vào chỉ tiêu [37] của kỳ tính thuế phát sinh nghĩa vụ thanh toán.

Theo Điều 4 Nghị định số 144/2026/NĐ-CP (sửa đổi, bổ sung điểm g khoản 2 Điều 26 Nghị định số 181/2025/NĐ-CP) và hướng dẫn tại mẫu 01/GTGT ban hành kèm Thông tư số 89/2026/TT-BTC, trường hợp sau khi đã điều chỉnh giảm, doanh nghiệp có được chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt thì được phép kê khai, khấu trừ bổ sung số thuế GTGT đầu vào tương ứng vào chỉ tiêu [38] của kỳ tính thuế phát sinh chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đó.

Bảng tổng hợp xử lý kê khai thuế GTGT hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp từ 05 triệu đồng trở lên:

Kê khai hóa đơn GTGT đầu vào chưa khai đúng kỳ

Đối với vướng mắc về việc kê khai hóa đơn GTGT đầu vào lập ngày 01/07/2025 nhưng chưa kê khai vào kỳ tính thuế tháng 7/2025, Thuế tỉnh Vĩnh Long hướng dẫn doanh nghiệp căn cứ vào trạng thái thực tế của hóa đơn (hóa đơn mới, hóa đơn điều chỉnh hay hóa đơn thay thế) và nghiệp vụ thực tế phát sinh tại đơn vị.

Doanh nghiệp thực hiện đối chiếu các dữ kiện này với các căn cứ pháp lý nêu trên và hướng dẫn kê khai chi tiết tại Phụ lục II ban hành kèm theo Thông tư số 89/2026/TT-BTC để thực hiện đúng quy định.

Góc nhìn chuyên môn từ MAN

Đội ngũ chuyên gia tại MAN – Master Accountant Network lưu ý doanh nghiệp cần nắm rõ cơ chế phân biệt giữa kê khai điều chỉnh trực tiếp trên tờ khai kỳ hiện tại (qua chỉ tiêu [37], [38]) và lập hồ sơ khai bổ sung cho kỳ phát sinh sai sót:

• Phân định chính xác hình thức kê khai: Chỉ khai vào chỉ tiêu [37] và [38] của kỳ phát hiện sai sót khi việc sai sót đó không làm phát sinh tăng số thuế GTGT phải nộp hoặc giảm số thuế đã được hoàn của kỳ quá khứ. Nếu làm tăng tiền thuế phải nộp hoặc giảm tiền thuế hoàn, doanh nghiệp bắt buộc phải lập hồ sơ khai bổ sung cho kỳ phát sinh sai sót.
• Theo dõi chặt chẽ thời hạn thanh toán hợp đồng: Bộ phận kế toán cần chủ động theo dõi các mốc thời gian thanh toán đối với hợp đồng mua hàng hóa, dịch vụ trả chậm từ 05 triệu đồng trở lên. Ngay khi đến hạn thanh toán mà chưa có chứng từ không dùng tiền mặt, kế toán thực hiện điều chỉnh giảm vào chỉ tiêu [37] của kỳ phát sinh nghĩa vụ thanh toán theo đúng hướng dẫn.
• Khấu trừ lại khi có chứng từ: Khi doanh nghiệp thanh toán không dùng tiền mặt sau thời điểm đã điều chỉnh giảm, kế toán thực hiện kê khai, khấu trừ lại số thuế GTGT đầu vào tương ứng vào chỉ tiêu [38] tại kỳ tính thuế phát sinh chứng từ thanh toán đó.

Doanh nghiệp có nhu cầu tư vấn sâu hơn về nghiệp vụ hoặc rà soát hồ sơ thuế có thể tham khảo dịch vụ kế toán thuế hoặc tìm hiểu báo giá dịch vụ kế toán trọn gói tại MAN để đảm bảo tính chuẩn xác cho hệ thống sổ sách.

Khuyến nghị và kết luận

Công văn số 2703/VLO-QLDN3 của Thuế tỉnh Vĩnh Long đưa ra hướng dẫn cụ thể cho trường hợp vướng mắc của người nộp thuế trong việc xử lý hóa đơn GTGT đầu vào bị sai sót và điều kiện khấu trừ thuế với hàng hóa, dịch vụ mua trả chậm, trả góp. Doanh nghiệp cần căn cứ tình hình thực tế, đối chiếu văn bản pháp luật liên quan để áp dụng đúng quy định. Khi phát sinh các ca hồ sơ phức tạp như đề nghị hoàn thuế GTGT, đơn vị nên tham vấn ý kiến chuyên môn để triển khai an toàn và hiệu quả.