Cách xác định thời gian miễn thuế 3 năm đầu cho doanh nghiệp vừa và nhỏ

Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký lần đầu sẽ được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm kể từ khi được cấp phép theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP và Nghị quyết 198/2025/QH15. Chính sách này áp dụng từ kỳ tính thuế 2025, giúp hỗ trợ tối đa cho các đơn vị khởi nghiệp sáng tạo và doanh nghiệp mới thành lập. MAN – Master Accountat Network sẽ hướng dẫn chi tiết cách xác định thời gian ưu đãi và các điều kiện áp dụng cụ thể trong bài viết dưới đây.

Tải file tóm tắt bài viết tại đây

Cách xác định thời gian miễn thuế 3 năm đầu đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa

Căn cứ theo khoản 3 Điều 7 Nghị định 20/2026/NĐ-CP, doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu được hưởng chính sách miễn thuế TNDN trong thời gian 03 năm. Việc xác định thời gian này dựa trên các mốc thời điểm pháp lý quan trọng.

Thời gian miễn thuế được tính liên tục kể từ năm đầu tiên doanh nghiệp được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu. Đây là mốc thời gian cứng, không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp đã phát sinh doanh thu hay lợi nhuận ngay trong năm đó hay chưa.

Về hiệu lực thi hành, Điều 16 Nghị định 20/2026/NĐ-CP quy định các nội dung về ưu đãi thuế tại Điều 7 sẽ có hiệu lực từ ngày Nghị quyết 198/2025/QH15 có hiệu lực và áp dụng kể từ kỳ tính thuế năm 2025. Theo Điều 17 Nghị quyết 198/2025/QH15, văn bản này có hiệu lực từ ngày Quốc hội thông qua, cụ thể là ngày 17/05/2025.

Như vậy, mốc thời gian được tính như sau:

Đối với doanh nghiệp thành lập mới: Tính 03 năm liên tục từ năm được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp.
Đối với doanh nghiệp đã thành lập trước ngày 17/05/2025: Nếu tại thời điểm Nghị quyết có hiệu lực mà doanh nghiệp vẫn còn trong thời hạn 03 năm kể từ ngày thành lập, doanh nghiệp sẽ được hưởng ưu đãi cho thời gian còn lại.

Quy định ưu đãi thuế TNDN đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa tại Nghị định 20/2026/NĐ-CP

Nghị định 20/2026/NĐ-CP không chỉ quy định về thời gian mà còn làm rõ phạm vi và các trường hợp được hưởng ưu đãi thuế TNDN. Các doanh nghiệp cần lưu ý 5 điều cốt lõi sau đây:

Điều 1: Ưu đãi cho hoạt động khởi nghiệp sáng tạo

Doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, công ty quản lý quỹ và tổ chức hỗ trợ khởi nghiệp được miễn, giảm thuế đối với phần thu nhập từ hoạt động này. Khác với doanh nghiệp nhỏ và vừa thông thường, thời gian ưu đãi ở đây tính từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế. Nếu 3 năm đầu chỉ có doanh thu nhưng chưa có thu nhập chịu thuế, thời gian ưu đãi sẽ bắt đầu tính từ năm thứ tư.

Doanh nghiệp phải hạch toán riêng phần thu nhập được ưu đãi; nếu không hạch toán riêng được thì xác định theo tỷ lệ doanh thu hoặc chi phí của hoạt động được ưu đãi trên tổng doanh thu hoặc chi phí.

Điều 2: Miễn thuế từ chuyển nhượng vốn

Doanh nghiệp được miễn thuế TNDN khi chuyển nhượng cổ phần, phần vốn góp vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, kể cả trường hợp bán doanh nghiệp. Tuy nhiên, quy định này loại trừ thu nhập từ chuyển nhượng cổ phiếu của công ty đại chúng hoặc niêm yết và các giao dịch gắn liền với bất động sản.

Điều 3: Đối tượng không được áp dụng ưu đãi

Để đảm bảo tính minh bạch, chính sách miễn thuế 3 năm đầu không áp dụng cho:

Doanh nghiệp thành lập do sáp nhập, hợp nhất, chia, tách hoặc chuyển đổi hình thức.
Trường hợp người quản lý hoặc người góp vốn chủ yếu đã tham gia kinh doanh tại doanh nghiệp khác trong thời gian chưa đủ 12 tháng tính đến ngày thành lập doanh nghiệp mới.
Các khoản thu nhập không được hưởng ưu đãi theo quy định của Luật Thuế TNDN (như thu nhập từ chuyển nhượng bất động sản, chuyển nhượng dự án đầu tư…).

Điều 4: Lựa chọn mức ưu đãi có lợi nhất

Trong trường hợp doanh nghiệp đồng thời đủ điều kiện hưởng nhiều chính sách ưu đãi thuế, doanh nghiệp được lựa chọn mức ưu đãi có lợi nhất và phải áp dụng ổn định trong suốt thời gian được miễn, giảm thuế.

Điều 5: Xử lý kỳ tính thuế đầu tiên dưới 12 tháng

Nếu năm đầu thành lập có thời gian hoạt động dưới 12 tháng, doanh nghiệp được lựa chọn hưởng ưu đãi ngay trong kỳ đầu tiên hoặc đăng ký với cơ quan thuế để bắt đầu hưởng ưu đãi từ kỳ tính thuế tiếp theo.

Doanh nghiệp nhỏ và vừa thành lập trước ngày 17/05/2025 có được miễn thuế TNDN?

Đây là thắc mắc chung của nhiều chủ doanh nghiệp thành lập trong giai đoạn chuyển tiếp pháp luật. Theo hướng dẫn tại Nghị định 20/2026/NĐ-CP, chính sách này có tính kế thừa để đảm bảo quyền lợi cho doanh nghiệp.

Cụ thể, những doanh nghiệp đã được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp trước ngày 17/05/2025 vẫn thuộc diện được xem xét miễn thuế. Điều kiện cần là tại thời điểm Nghị quyết 198/2025/QH15 có hiệu lực, doanh nghiệp đó vẫn còn trong thời gian 03 năm miễn thuế tính từ ngày cấp phép lần đầu.

Ví dụ: Doanh nghiệp A thành lập tháng 06/2024. Đến ngày 17/05/2025, doanh nghiệp này mới hoạt động được gần 1 năm. Như vậy, doanh nghiệp A sẽ được tiếp tục hưởng chính sách miễn thuế TNDN cho khoảng thời gian hơn 2 năm còn lại theo quy định mới, áp dụng bắt đầu từ kỳ tính thuế năm 2025.

Một lưu ý quan trọng là doanh nghiệp tự xác định các điều kiện ưu đãi, mức miễn thuế, giảm thuế để tự kê khai và tự quyết toán thuế với cơ quan thuế. Việc xác định đúng thời gian và điều kiện miễn thuế không chỉ giúp doanh nghiệp tối ưu tài chính mà còn đảm bảo tính tuân thủ pháp luật thuế, tránh các rủi ro bị truy thu hoặc xử phạt về sau.

Liên Hệ Tư Vấn

Thông tin liên hệ MAN – Master Accountant Network

Địa chỉ: Số 19A, đường 43, phường Tân Thuận, TP. Hồ Chí Minh
Mobile/Zalo: 0903 963 163 – 0903 428 622
Email: man@man.net.vn

Các dịch vụ khác

Phụ trách sản xuất nội dung bởi: Ông Lê Hoàng Tuyên – Sáng lập viên (Founder) & CEO MAN – Master Accountant Network, Kiểm toán viên CPA Việt Nam với hơn 30 năm kinh nghiệm trong ngành Kế toán, Kiểm toán và Tư vấn Tài chính.